在海上的战斗一度陷入僵局的时候，郑建功和施琅又指挥了“第二次樱岛登陆”。这一次登陆的地点在樱岛西北，这一带地势平坦，适合登陆的滩头长度达到十三四里，而且还有许多渔港可供使用。
另外，萨摩藩方面完全没有想到联军舰队可以顶着他们的火炮冲进樱岛海峡——岛津光久显然高估了西班牙人提供的6磅和12磅大炮的威力！
所以在樱岛西北的漫长滩头上并没有几个萨州武士在等待数以千计全副武装的明军步兵——这些步兵虽然没有装备燧发枪（一个步兵师只有一个燧发枪团，第一师的燧发枪团被留在了五岛列岛和长崎），但是他们人人都拥有板甲，每个步兵团还有一个长枪连（因为日本的骑兵不构成多大的威胁，所以长枪兵的数量减少了），肉搏战的能力很强！
他们可不会和之前在樱岛西南登陆的不披甲的海军陆战队一样，虽然在枪战中取得了压倒性的优势，但是在之后的刺刀突击中被数量远少于己方的萨州武士抵挡住。后来还是依靠第二波登陆的陆军步兵的增援，才将萨州军完全击退巩固了滩头阵地......但是也仅仅抢下了滩头，并没有能力向樱岛炮台推进。因为樱岛西南的地形比较险要，在明军的滩头阵地外围就是密林和山地。至少2000名萨州武士盘踞在那里，利用地形阻挡明军推进。
但也正是因为樱岛上的萨州军将主要兵力都摆在西南方向上，造成了西北方向上的兵力极度空虚。在李元胤率领两个步兵团和一个炮兵连完成登陆后，明军就势如破竹般的推进到了樱岛炮台附近，而萨州军的樱岛炮台又忽略了背后的防御。所以守军只好在炮台西北的开阔地带和明军展开毫无获胜希望的野战，最后几乎全军覆没！
而在明军陆军攻打樱岛炮台的同时，郑建功也抽调出八艘万石大鸟船，向西班牙人的战船发起了一场火船进攻，将八艘堵着航道的西班牙战船完全摧毁！
失去了这八艘战船后，西班牙东方无敌舰队的实力已经损失殆尽......大明海军则一跃成为了西太平洋上的霸主！
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